基层农科院所资源不足，处于发展的弱势地位。但强和弱并不是永恒不变的，构建创新体系就是转弱为强的办法。明确构建路线、优化创新载体、拓展创新源头、集聚创新人才、完善创新机制，是达到这一目标的有效途径。
明确构建路线
按照源足、库大、流畅的区域农业科技创新中心的目标，上游科技试验田、下游技术供应站的功能进行定位，搭建产学研用一体化的农业科技创新体系。以增强科技创新、成果供给、技术吸纳的自主性为立足点，坚持上融入、横联合、下辐射，小实体、大网络、集成化的构建方针，围绕农业产业技术体系、共性技术研发体系、农科教协作体系建设，以调整科技布局切入点，改革体制机制为突破口，建设创新文化为支撑点，构建上中下游无缝对接的科技创新价值链，组建集研发、示范、推广三位一体的科研团队，打造项目研究、科研推广、科技服务三位一体的科技平台，将最新、最实用的品种和技术在最短时间内送到农民手中。
优化创新载体
以科研活动组织模式改革为主线，完善创新价值链，实现资源收集、功能挖掘、技术创新和成果转化的高效联动。在内部创新建制上，合并同类项，以区域主导产业为主线建立产业研发中心，以农业共性技术为核心建立共性技术研发中心，以提供公共产品为目标建立公共研发服务平台，促进人才、项目、基地的一体化建设。在区域资源整合上，以市级院所为枢纽，建立农业科技创新中心，以设置创新岗位的形式打破现有农业科教单位的界限，搭建一个覆盖广泛、功能整合的科技研发平台，统筹农业科研项目管理，优化区域科技研发布局，实现各创新单元功能互补、联合互动、形成合力，提升体系创新能力。
拓展创新源头
切实推进与国家和省级农业科技创新体系的合作，着力加强项目合作、机构合作、人才交流、平台引进、信息交流，不断充实合作内容，提高合作层次和产业技术创新的组织程度。实施增强特色、拓宽基础、加强交叉、扩大覆盖、助强扶弱的学科发展战略，形成面向国家粮食安全和地方优势产业，农科教、产学研有机结合，从产业技术到共性技术研究的区域农业科技创新体系，走出一条高端化、集成化、规模化科技创新路子。
集聚创新人才
以学科建设为主线，通过基础设施投入和科技创新项目的带动，以任务带团队，以团队促网络，以网络建体系，打造紧密合作型研发群体，培育一批研究方向明确、领军人物突出、人才梯队合理、科研平台层次较高的创新团队，形成以首席专家为学科核心、以创新团队为学科基础、以研究基地为学科依托的三位一体发展模式。
完善创新机制
坚持扬优支重、改老抚新的学科建设方针，打好组合拳。硬件和软件、人才和设施、支撑和引领两手都要硬。上级经费集中支持重点学科建设，自筹经费支持非重点学科建设，能争取社会资源的项目不运用本所资源，确保队伍建设经费，加大平台建设投入，确保学科建设、队伍建设、科研课题的相应投入不受干扰。坚持事业与产业双轮驱动的方针，加强与农业院校、推广单位、农业企业、农民组织的资源整合，通过集成创新培育重大成果。坚持组织起来与提高技术相结合的方针，充分发挥基层院所在联系农民、组织农民、动员农民方面的重要作用，不断增强农民的技术吸纳能力。
